Az ebben a virtuális környezetben futó programok ezek után csak ebben a Sandboxie által elérhető adatokon - fájlok, Registry bejegyzések - képesek változtatni. A programok viszont nem érzékelik, hogy csak egy homokozóban járnak, és a fájl és egyéb műveleteiket csak egy dedikált könyvtáron belül végezhetik. Így ha egy alkalmazástól meg kívánunk szabadulni, elég a Sandboxie-n belüli könyvtárát kitörölni. Segítségével például biztonságosan szörfölhetünk a világhálón, ilyenkor ugyanis a cookie állományok, kémprogramok, és más rosszindulatú programok nem képesek megfertőzni az igazi gépünket.
